Прийом антибіотиків не завжди допомагає впоратися із захворюванням. Часто їх дії заважають бактерії, що живуть у травному тракті людини: вони обмінюються генами з хвороботворними бактеріями і ті виробляють опірність антибіотикам, перетворюючись на супербактерії, від яких не існує ефективних ліків. Тому знання резистому - набору генів опірності в мікрофлорі кишечника - може значно поліпшити результати лікування. Однак традиційний метод отримання даних про резистентність займає тижні. За цей час резистом може суттєво змінитися.
Новий метод, названий poreFUME, використовує секвенування генома бактерій за допомогою нанопор. Порівняно з аналогами він діє дуже швидко, тому що не вимагає вирощування фекальних бактерій, довгого і непростого процесу. Крім того, винайдений данськими вченими пристрій транслює дані в реальному часі, так що користувач не повинен чекати закінчення аналізу, щоб почати вивчати інформацію.
Щороку від стійких до антибіотиків інфекцій помирає 700 000 пацієнтів переважно в лікарнях. Багатьом з них інформація про резистентність власних генів може врятувати життя.
«За допомогою нашого методу можна за 1-2 дні отримати повний звіт про резистом і, як наслідок, почати лікування захворювання швидше і з кращими результатами, ніж раніше», - говорить Ерік ван дер Хельм, один з авторів статті, опублікованої в журналі Nucleic Acid Research.
Результати експерименту показали 97% точність методу poreFUME порівняно зі звичайними технологіями визначення резистому. Крім того, завдяки використанню компактного пристрою секвенування MiniON, вартість процедури виявилася порівняно низькою. Один такий апарат коштує від $1000, тоді як аналогічні пристрої секвенування обходяться від $50 000 до $10 млн, пише EurekAlert.
Вчені знайшли докази того, що Всесвіт - це голограма
Кейси
Стійка до новітніх видів антибіотиків ентеробактерія інфікує в рік майже 9300 жителів США і вбиває близько 900. Її і раніше було складно простежити, а тепер вона зуміла виробити опірність навіть до карбапенемів - новітнього класу антибіотиків. Американські вчені виявляють стурбованість у зв'язку з поширенням цієї інфекції.
